广告联盟小游戏APP软件系统的定制搭建开发，特别是在源码搭建方面，是一个涉及多个步骤和技术层面的过程。以下是一个详细的指南，帮助您了解这一过程：

1. 市场调研与需求分析

确定目标：明确小游戏的目标用户群体、核心玩法、预期盈利模式以及广告策略12。

研究市场：了解市场上类似的小游戏和广告联盟的表现，以及用户的行为和需求12。

2. 技术选型与架构设计

选择开发语言：虽然问题中提到了Java，但在小游戏开发中，也可以使用其他语言或框架，如Unity、Cocos2d-x、Flutter等，这些框架提供了丰富的功能和工具13。

设计架构：设计清晰的前后端架构，确保数据的安全性、可扩展性和可维护性1。

数据库选择：选定适合项目需求的数据库系统，如MySQL、SQLite等1。

3. 源码搭建与功能实现

游戏开发：使用选定的游戏引擎开发游戏，包括设计游戏逻辑、界面、音效、动画效果等13。

广告集成：选择合适的广告联盟（如Google AdMob、Facebook Audience Network等），注册开发者账号，下载SDK并集成到游戏源码中13。在游戏界面中设计合适的广告位，如启动页、关卡间、暂停页等，确保广告与游戏内容整合良好，不影响用户体验1。

用户系统：实现用户注册、登录、个人信息管理等功能1。

佣金系统：实现佣金的计算、累积、查询和兑换等功能，用户通过观看广告获得佣金，可兑换成游戏内道具或提现1。

4. 测试与优化

功能测试：进行单元测试、集成测试和用户体验测试，确保游戏的稳定性和用户体验1。

广告测试：测试广告的展示、点击、收益统计等功能，确保广告能够正常显示且不影响游戏体验13。

性能优化：优化游戏的运行性能和广告的加载速度，确保良好的用户体验23。

5. 部署与发布

部署应用：将应用部署到服务器或云平台上，确保应用可以正常运行1。

提交审核：将应用提交到各大应用商店进行审核和发布1。

6. 数据分析与运营

收集数据：收集并分析用户数据，了解用户行为和需求，为优化应用提供依据1。

调整策略：根据用户反馈和市场变化，持续更新和优化应用1。

注意事项

遵守法规：确保游戏开发和广告展示符合相关法律法规，特别是关于隐私保护、广告内容和儿童在线隐私保护法案(COPPA)等方面的规定4。

用户体验：广告展示应不影响用户体验，避免过多的广告打扰用户4。

安全性：确保应用的安全性，如数据加密、防止SQL注入、优化网络请求等1。

请注意，以上步骤仅供参考，具体的开发流程和源码搭建方法可能因项目需求、技术选型、市场环境等因素而有所不同。在开发过程中，建议与的开发团队或顾问合作，以确保项目的顺利进行和高质量完成。