万店联盟模式商城系统的开发是一个复杂而系统的过程，旨在构建一个能够支持大量商家加入并共同协作的电商平台或合作网络。以下是对该系统开发过程的一个概述：

. 明确目标与规划

首先，需要明确万店联盟模式商城系统的核心功能和目标，如商品展示与管理、订单处理、支付集成、分销体系构建、数据分析与统计等。根据目标用户群体和市场需求，规划系统的整体架构和功能模块，确保系统能够满足不同用户的多样化需求。

. 技术选型与架构设计

选择合适的技术栈和开发工具进行开发。前端开发可以选择HTML/CSS/JavaScript等技术，后端开发可以选择Java、Python、PHP等语言，数据库可以选择MySQL、MongoDB等。设计系统的整体架构，包括前端界面设计、后端服务器架构、数据库设计等，确保系统的稳定性和可扩展性。

3. 功能模块开发

根据规划，开发系统的各个功能模块。这包括：

商品展示与管理模块：提供丰富的商品分类和搜索功能，方便消费者快速找到所需商品。同时，支持商品详情页自定义、商品库存管理等功能，方便商家管理商品信息。

订单处理模块：实现用户下单、支付、发货、退换货等全流程管理。支持多种支付方式以满足不同用户的支付需求。

分销体系构建模块：设计合理的分销政策，激励会员参与分销活动并分享收益。可以采用微信三级分销的返利政策或其他类似的策略，设置自定义分销门槛和佣金比例，实时计算并展示用户的佣金收入情况。

数据分析与统计模块：提供销售统计、收益统计、粉丝统计等功能，帮助商家了解平台运营情况，并根据数据分析结果调整运营策略，优化产品和服务。

4. 测试与优化

对系统进行详尽的测试，包括功能测试、性能测试、安全测试等，确保系统的稳定性和安全性。根据测试结果进行修复bug和优化用户体验，提高系统的稳定性和易用性。

5. 上线与运营

将系统上线并进行宣传推广，吸引更多用户和商家使用。在运营过程中，根据用户反馈和市场需求进行迭代和优化，提升用户体验和服务质量。

6. 法律法规与合规性

在开发过程中，要严格遵守相关法律法规和平台政策，确保系统的合法性和合规性。

7. 持续优化与创新

随着商业的不断发展和网络覆盖率的提高，万店联盟模式商城系统需要在技术、功能和用户体验等方面持续优化和创新，以适应市场变化并实现更广泛的互利共赢。

综上所述，万店联盟模式商城系统的开发需要专业的技术团队和丰富的经验支持，以确保系统的稳定性和用户体验。同时，需要注重法律法规的遵守和系统的持续优化与创新。